{ "id": 197552, "title": "腎臓について最低限 日本語", "url": "/competitions/hubmap-kidney-segmentation/discussion/197552", "author_name": "", "post_date": "2020-11-17T01:24:38.246861500Z", "votes": 32, "comment_count": 9, "views": 0, "content": "

本コンペのテーマは腎臓にある「糸球体」を識別するセグメンテーションアルゴリズムの開発。
\nこのDiscussionでは本コンペで重要になる腎臓の「組織的」な話を書く。腎臓の働きには触れない。

\n

画像データは腎臓の「組織」画像。
\n組織画像とは腎臓から小さな切片を切り出して、見やすいように染色し、顕微鏡で拡大することで文字通りそのミクロな組織構造を見れるようにしたものである。

\n

はじめは糸球体は腎臓におけるミクロな構造のひとつと思ってもらえれば良い。
\nなので肉眼ではなく組織画像で見るというわけだ。

\n

腎臓の構造、さらにミクロに糸球体の構造が一般の方にでもわかりそうなサイトがあった。画像メインで見ると良い。図1→図2の順でよりミクロに見ている。
\nhttps://www.kango-roo.com/learning/1677/
\n『腎臓の構造と機能｜捨てる（2）』

\n

また組織画像にも正常な腎臓の組織画像と病気の人の組織画像がある。
\n当然、糸球体が壊れてしまうような疾患もあるので、糸球体がどのような形かみるためには「糸球体　正常組織」と検索する。
\n逆に病気の人のものを見たいときは「病理組織」と検索をする。
\n正常組織か病理組織かは一般の人が初見で見分けがつかないものも多々あるのでこの点に特に留意して下調べをしてほしい。
\n正常な組織画像でわかりやすそうなサイトを貼る
\nhttp://www.med.teikyo-u.ac.jp/~kaibo/soshiki/urinary_system/02.html
\n『泌尿器系 - 組織学実習 - 帝京大学医学部解剖学教室』

\n

これは個人的な見方だが、糸球体はブロッコリーの頭やドラゴンフルーツの断面のような見た目をしている。

\n

一般の人向けに、なるだけ噛み砕いた内容になっているので不正確な部分もあるかもしれないがご了承いただければ幸いだ。

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本コンペのテーマは腎臓にある「糸球体」を識別するセグメンテーションアルゴリズムの開発。
\nこのDiscussionでは本コンペで重要になる腎臓の「組織的」な話を書く。腎臓の働きには触れない。

\n

画像データは腎臓の「組織」画像。
\n組織画像とは腎臓から小さな切片を切り出して、見やすいように染色し、顕微鏡で拡大することで文字通りそのミクロな組織構造を見れるようにしたものである。

\n

はじめは糸球体は腎臓におけるミクロな構造のひとつと思ってもらえれば良い。
\nなので肉眼ではなく組織画像で見るというわけだ。

\n

腎臓の構造、さらにミクロに糸球体の構造が一般の方にでもわかりそうなサイトがあった。画像メインで見ると良い。図1→図2の順でよりミクロに見ている。
\nhttps://www.kango-roo.com/learning/1677/
\n『腎臓の構造と機能｜捨てる（2）』

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また組織画像にも正常な腎臓の組織画像と病気の人の組織画像がある。
\n当然、糸球体が壊れてしまうような疾患もあるので、糸球体がどのような形かみるためには「糸球体　正常組織」と検索する。
\n逆に病気の人のものを見たいときは「病理組織」と検索をする。
\n正常組織か病理組織かは一般の人が初見で見分けがつかないものも多々あるのでこの点に特に留意して下調べをしてほしい。
\n正常な組織画像でわかりやすそうなサイトを貼る
\nhttp://www.med.teikyo-u.ac.jp/~kaibo/soshiki/urinary_system/02.html
\n『泌尿器系 - 組織学実習 - 帝京大学医学部解剖学教室』

\n

これは個人的な見方だが、糸球体はブロッコリーの頭やドラゴンフルーツの断面のような見た目をしている。

\n

一般の人向けに、なるだけ噛み砕いた内容になっているので不正確な部分もあるかもしれないがご了承いただければ幸いだ。

", "rawMarkdown": "本コンペのテーマは腎臓にある「糸球体」を識別するセグメンテーションアルゴリズムの開発。\nこのDiscussionでは本コンペで重要になる腎臓の「組織的」な話を書く。腎臓の働きには触れない。\n\n画像データは腎臓の「組織」画像。\n組織画像とは腎臓から小さな切片を切り出して、見やすいように染色し、顕微鏡で拡大することで文字通りそのミクロな組織構造を見れるようにしたものである。\n\nはじめは糸球体は腎臓におけるミクロな構造のひとつと思ってもらえれば良い。\nなので肉眼ではなく組織画像で見るというわけだ。\n\n腎臓の構造、さらにミクロに糸球体の構造が一般の方にでもわかりそうなサイトがあった。画像メインで見ると良い。図1→図2の順でよりミクロに見ている。\nhttps://www.kango-roo.com/learning/1677/\n『腎臓の構造と機能｜捨てる（2）』\n\nまた組織画像にも正常な腎臓の組織画像と病気の人の組織画像がある。\n当然、糸球体が壊れてしまうような疾患もあるので、糸球体がどのような形かみるためには「糸球体　正常組織」と検索する。\n逆に病気の人のものを見たいときは「病理組織」と検索をする。\n正常組織か病理組織かは一般の人が初見で見分けがつかないものも多々あるのでこの点に特に留意して下調べをしてほしい。\n正常な組織画像でわかりやすそうなサイトを貼る\nhttp://www.med.teikyo-u.ac.jp/~kaibo/soshiki/urinary_system/02.html\n『泌尿器系 - 組織学実習 - 帝京大学医学部解剖学教室』\n\nこれは個人的な見方だが、糸球体はブロッコリーの頭やドラゴンフルーツの断面のような見た目をしている。\n\n一般の人向けに、なるだけ噛み砕いた内容になっているので不正確な部分もあるかもしれないがご了承いただければ幸いだ。", "votes": null }, { "id": "1082002", "postDate": "11/17/2020 14:03:04", "content": "

Would be great to see a translation as well :)
\n(Not for the sources of course, but maybe some describing text to the message itself).

", "rawMarkdown": "Would be great to see a translation as well :) \n(Not for the sources of course, but maybe some describing text to the message itself).", "votes": null }, { "id": "1082499", "postDate": "11/18/2020 00:43:41", "content": "

English is below.
\nhttps://www.kaggle.com/c/hubmap-kidney-segmentation/discussion/197764

", "rawMarkdown": "English is below.\nhttps://www.kaggle.com/c/hubmap-kidney-segmentation/discussion/197764", "votes": null }, { "id": "1082504", "postDate": "11/18/2020 00:55:01", "content": "

I wrote the translation below.
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\nHope this helps

", "rawMarkdown": "I wrote the translation below.\nhttps://www.kaggle.com/c/hubmap-kidney-segmentation/discussion/197764\nHope this helps", "votes": null }, { "id": "1082876", "postDate": "11/18/2020 10:21:07", "content": "

Thank you very much!

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I have done a study on the semantic segmentation of kidney pathology images at Nagoya University. Regarding the staining method of pathological images, if the staining method is different, will it affect the doctor's observation of the glomeruli? 　ども　ありがとうございます。

", "rawMarkdown": "I have done a study on the semantic segmentation of kidney pathology images at Nagoya University. Regarding the staining method of pathological images, if the staining method is different, will it affect the doctor's observation of the glomeruli? 　ども　ありがとうございます。", "votes": null }, { "id": "1086744", "postDate": "11/22/2020 02:28:46", "content": "

Thanks for your comment.

\n

Although there are minor color differences depending on the staining method, from a doctor's point of view, glomeruli can be easily identified by any staining.
\nHowever, I don't know if it is easy for the segmentation algorithm.

\n

￬ Reference images of HE, PAS, PAM staining of kidney
\nhttps://www.researchgate.net/figure/PAS-and-PAM-staining-of-kidney-sections-sampled-day-4-d-f-and-weeks-3-g-i-and-5-j-l_fig6_8603084

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Do you have a publication of your study that you could share?

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I do not have a publication of my own study.

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Okay, thanks for your reply!

", "rawMarkdown": "Okay, thanks for your reply!", "votes": null } ], "comments": [ { "id": 1082002, "author_name": "purplejester", "author_url": "", "post_date": "11/17/2020 14:03:04", "content": "

Would be great to see a translation as well :)
\n(Not for the sources of course, but maybe some describing text to the message itself).

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I wrote the translation below.
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\nHope this helps

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Thank you very much!

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English is below.
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I have done a study on the semantic segmentation of kidney pathology images at Nagoya University. Regarding the staining method of pathological images, if the staining method is different, will it affect the doctor's observation of the glomeruli? 　ども　ありがとうございます。

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Thanks for your comment.

\n

Although there are minor color differences depending on the staining method, from a doctor's point of view, glomeruli can be easily identified by any staining.
\nHowever, I don't know if it is easy for the segmentation algorithm.

\n

￬ Reference images of HE, PAS, PAM staining of kidney
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Do you have a publication of your study that you could share?

", "votes": null, "replies": [] }, { "id": 1088965, "author_name": "dlbsabu", "author_url": "", "post_date": "11/24/2020 05:07:09", "content": "

I do not have a publication of my own study.

", "votes": null, "replies": [] }, { "id": 1089469, "author_name": "leahscherschel", "author_url": "", "post_date": "11/24/2020 14:27:44", "content": "

Okay, thanks for your reply!

", "votes": null, "replies": [] } ] } ], "raw_markdown_by_id": { "1081313": "本コンペのテーマは腎臓にある「糸球体」を識別するセグメンテーションアルゴリズムの開発。\nこのDiscussionでは本コンペで重要になる腎臓の「組織的」な話を書く。腎臓の働きには触れない。\n\n画像データは腎臓の「組織」画像。\n組織画像とは腎臓から小さな切片を切り出して、見やすいように染色し、顕微鏡で拡大することで文字通りそのミクロな組織構造を見れるようにしたものである。\n\nはじめは糸球体は腎臓におけるミクロな構造のひとつと思ってもらえれば良い。\nなので肉眼ではなく組織画像で見るというわけだ。\n\n腎臓の構造、さらにミクロに糸球体の構造が一般の方にでもわかりそうなサイトがあった。画像メインで見ると良い。図1→図2の順でよりミクロに見ている。\nhttps://www.kango-roo.com/learning/1677/\n『腎臓の構造と機能｜捨てる（2）』\n\nまた組織画像にも正常な腎臓の組織画像と病気の人の組織画像がある。\n当然、糸球体が壊れてしまうような疾患もあるので、糸球体がどのような形かみるためには「糸球体　正常組織」と検索する。\n逆に病気の人のものを見たいときは「病理組織」と検索をする。\n正常組織か病理組織かは一般の人が初見で見分けがつかないものも多々あるのでこの点に特に留意して下調べをしてほしい。\n正常な組織画像でわかりやすそうなサイトを貼る\nhttp://www.med.teikyo-u.ac.jp/~kaibo/soshiki/urinary_system/02.html\n『泌尿器系 - 組織学実習 - 帝京大学医学部解剖学教室』\n\nこれは個人的な見方だが、糸球体はブロッコリーの頭やドラゴンフルーツの断面のような見た目をしている。\n\n一般の人向けに、なるだけ噛み砕いた内容になっているので不正確な部分もあるかもしれないがご了承いただければ幸いだ。", "1082002": "Would be great to see a translation as well :) \n(Not for the sources of course, but maybe some describing text to the message itself).", "1082499": "English is below.\nhttps://www.kaggle.com/c/hubmap-kidney-segmentation/discussion/197764", "1082504": "I wrote the translation below.\nhttps://www.kaggle.com/c/hubmap-kidney-segmentation/discussion/197764\nHope this helps", "1082876": "Thank you very much!", "1086042": "I have done a study on the semantic segmentation of kidney pathology images at Nagoya University. Regarding the staining method of pathological images, if the staining method is different, will it affect the doctor's observation of the glomeruli? 　ども　ありがとうございます。", "1086744": "Thanks for your comment.\n\nAlthough there are minor color differences depending on the staining method, from a doctor's point of view, glomeruli can be easily identified by any staining.\nHowever, I don't know if it is easy for the segmentation algorithm.\n\n￬ Reference images of HE, PAS, PAM staining of kidney \nhttps://www.researchgate.net/figure/PAS-and-PAM-staining-of-kidney-sections-sampled-day-4-d-f-and-weeks-3-g-i-and-5-j-l_fig6_8603084", "1088564": "Do you have a publication of your study that you could share?", "1088965": "I do not have a publication of my own study.", "1089469": "Okay, thanks for your reply!" }, "source": "meta" }